Programi i arsimit të lartë është një nga fushat kryesore mbi të cilën ekipi i Qëndresës prej 4 vjetësh kryen hulumtime dhe monitorime. Fokusi kryesor i programit ka qënë mbi zbatimin e ligjit 80/2015 për Arsimin e Lartë dhe “Paktit për Universitetin”. Qëllimi i programit është nxitja e debatit mbi arsimin dhe përfshirja e studentëve në vendimmarrjen e universiteteve publike.